新冠病毒

新型冠狀病毒（嚴(yán)重急性呼吸道綜合征冠狀病毒2，Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2），最初發(fā)現(xiàn)于2019年，也可稱為2019新型冠狀病毒。是乙型冠狀病毒中的一個分型，與2003年SARS病毒相似。該病毒株以前從未在人體中發(fā)現(xiàn)，人感染后會出現(xiàn)呼吸道癥狀、咳嗽、發(fā)燒、呼吸困難，部分患者嗅覺味覺消失，嚴(yán)重的病例中出現(xiàn)嚴(yán)重的呼吸綜合征、肺炎、肺纖維化、腎衰竭，甚至死亡。該病毒主要通過上呼吸道入侵人體，主要感染肺、心臟、腎等多種器官。

該病毒具有包膜的、不分節(jié)段的正鏈單股RNA病毒，顆粒呈圓形或橢圓形，直徑約80～120nm。具有包膜的正鏈單鏈RNA病毒，較容易突變，目前多種變種在全球發(fā)現(xiàn)。

目前病毒檢測主要是核酸檢測和抗原檢測。核酸檢測在病毒感染后就可以檢測出，是檢測病毒感染與否的直接證據(jù)，抗原抗體檢測是患者感染3d后出現(xiàn)抗體，是檢測病毒感染的間接證據(jù)。

核酸檢測主要是通過實(shí)時熒光定量PCR檢測新冠病毒保守的片段區(qū)域的序列，以確定體內(nèi)是否含有該病毒。當(dāng)定量PCR檢測出有該序列，說明有可能感染了病毒，會通過多次PCR進(jìn)行檢測并結(jié)合臨床檢測指標(biāo)進(jìn)行確診。

實(shí)時熒光定量PCR使用Taqman法進(jìn)行檢測，使用針對病毒2個或更多的保守區(qū)域特異性引物和探針（不同國家或地區(qū)檢測的區(qū)域不一致，我國主要是檢測ORF1ab和N區(qū)域這2個保守區(qū)域）

圖1 新冠病毒基因組圖及PCR靶基因檢測區(qū)域

圖2 核酸檢測流程（據(jù)Enzolifesciences）

咽拭子樣本采集后運(yùn)送至實(shí)驗(yàn)室生物安全柜中直接進(jìn)行下列處理，樣本也可以在4℃冰箱中儲存不超過7天。

（1）預(yù)處理：樣本中加入Remel Sputasol (Thermo Fisher Scientific)對粘性樣本進(jìn)行預(yù)處理。

（2）病毒滅活：將50μl樣本在99℃加熱5min，將病毒滅活。將樣本轉(zhuǎn)移至離心機(jī)中4000rpm離心5min。（有的試劑盒需要提取核酸）

（3）逆轉(zhuǎn)錄+PCR檢測：取5μl樣本加入逆轉(zhuǎn)錄和PCR反應(yīng)體系中。

反應(yīng)體系包含：逆轉(zhuǎn)錄酶、DNA聚合酶、特異性引物、特異性probe，并使用乙肝病毒HBVS抗原序列作為內(nèi)控。

PCR mix體系

PCR反應(yīng)程序